Khi một người mắc phải RLTT, có thể 1 hay nhiều chức năng não bộ bị ảnh hưởng. Và bởi vì các chức năng này có liên kết với nhau, nên khi một chức năng nào đấy hoạt động không đúng, nó cũng có thể sẽ ảnh hưởng đến các chức năng còn lại. Trong trường hợp rối loạn lo âu, những cơ chế của chức năng cảnh báo không hoạt động theo cách bình thường. Điều này dẫn tới họ sẽ có cảm giác đang gặp nguy hiểm, hoặc là họ đang an toàn tuyệt đối.